Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms