Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRHQ9HD43 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRHQ9HD43 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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