Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms