Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZYG11BQ9C0D3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms