Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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