Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA3Q9BQP9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 283.6 ms