Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms