Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSAMQ8N6F7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms