Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms