Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G9

ZNF449, Zinc finger protein 449, humanhuman

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Length 518 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF449Q6P9G9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ZNF449Q6P9G9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF449Q6P9G9 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms