Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL2Q6F5E8 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms