Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEF1DP3Q658K8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEF1DP3Q658K8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms