Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms