Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPAT3Q53EU6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms