Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PUS10Q3MIT2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUS10Q3MIT2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms