Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms