Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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