Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms