Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms