Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms