Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
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CHD4Q14839 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CHD4Q14839 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CHD4Q14839 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CHD4Q14839 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CHD4Q14839 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CHD4Q14839 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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CHD4Q14839 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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CHD4Q14839 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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CHD4Q14839 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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