Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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