Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNIQ14094 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms