Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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CBFBQ13951 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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