Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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