Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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IRF5Q13568 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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IRF5Q13568 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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