Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms