Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TRAF1Q13077 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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TRAF1Q13077 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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TRAF1Q13077 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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TRAF1Q13077 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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TRAF1Q13077 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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