Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms