Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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