Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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FOXC1Q12948 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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