Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FOXF2Q12947 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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