Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms