Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms