Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms