Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A2Q05940 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms