Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREMQ03060 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREMQ03060 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CREMQ03060 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREMQ03060 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREMQ03060 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREMQ03060 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREMQ03060 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms