Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BEX3Q00994 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms