Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELF3P78545 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELF3P78545 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELF3P78545 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms