Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HBBP68871 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms