Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms