Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01547P58512 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms