Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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