Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms