Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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PGGT1BP53609 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PGGT1BP53609 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PGGT1BP53609 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PGGT1BP53609 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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