Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBP50607 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBP50607 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBP50607 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBP50607 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBP50607 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBP50607 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBP50607 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBP50607 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBP50607 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBP50607 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBP50607 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBP50607 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBP50607 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBP50607 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBP50607 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBP50607 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBP50607 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms