Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPIAP49247 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms