Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A3P48751 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms