Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms