Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms